近期，我國原料藥行業遭遇嚴峻挑戰。一方面，出口增速低位徘徊。2013年上半年，我國原料藥出口額同比僅增3.08%;出口量同比增7.46%。另一方面，盈利能力薄弱。2013年上半年，我國原料藥出口平均單價同比降4.07%。

中信建投經濟咨詢醫藥醫療行業研究員張瑞汶認為，發達國家經濟復蘇緩慢、新興市場國家貨幣貶值、醫藥消費能力減弱等是原料藥出口不景氣的主要原因;而產能過剩、競爭激烈、環保成本高導致了原料藥盈利能力下降。

張瑞汶指出，技術門檻低，產能復制容易，產品無差異化是致使部分產品產能過剩的原因之一。尤其是在新版GMP改進過程中，快速的固定資產投資極易使技術含量相對不高的原料藥制造業出現產能過剩的問題，進而壓低行業的整體利潤，造成惡性競爭。同時， 原料藥是很多劑成藥的原料，用途廣泛，但由于處于整個醫藥生物試劑環節zui低端，其附加值和利潤率都極低。另一方面，原料藥行業具有高污染、高耗能特點，近期隨著我國環保政策的大力推行，原料藥企業面臨的矛盾日益突出。在當前經濟結構升級的壓力下，“高耗能、高污染、低附加值”的原料藥企業面臨嚴峻的挑戰。

由于我國原料藥及中間體生物試劑優勢明顯,品種多、產量大、價格便宜,，行業蘊含巨大市場容量。企業應停止惡性競爭，把提高的利潤所得投入到環保處理，對整個行業將產生巨大的良性循環;并且從利潤低的基礎原料藥向特色原料藥、利潤率更高的下游制劑制造轉型，同時積極開發新仿制藥的原料藥，這將是我國原料藥行業突破“瓶頸”的新出路。

中信建投經濟咨詢發布的《2013-2015中國食品生物制藥行業投資分析及趨勢預測報告》指出，未來,原料藥行業將從集中低端轉型為多層次的產品體系。5年內,中國生物試劑的大宗原料藥在質量、成本上仍具有優勢,基礎藥品的需求也在不斷增長,仍需要符合標準的大宗原料藥企業。隨著一部分企業向產品升級,加上越來越緊的政策環境,這部分市場將迎來兼并整合。

中信建投經濟咨詢研究總監周銳指出，在經濟不景氣、醫藥需求不振的背景下，開拓新興市瞅將成為我國原料藥出口的一種重要途徑。